سپسیس نوزادی به عفونتی اطلاق می‌شود که جریان خون را در نوزادان کمتر از 28 روز درگیر می‌کند. این بیماری یکی از علل اصلی مرگ و میر در میان نوزادان است که نیاز به تشخیص زود هنگام و درمان مناسب دارد. تشخیص زود هنگام ممکن است از مصرف نادرست آنتی بیوتیک ها جلوگیری کند. گزارش شده است که هر ساعت تأخیر در درمان مؤثر با 6/7٪ کاهش در بقا همراه است. کشت خون معمولی (BC) روش استاندارد طلایی برای تشخیص پاتوژن های خون است، با این حال محدودیت‌های مشخصی دارد، از جمله زمان‌بر بودن (تأخیر در درمان) و تنها می‌تواند میکروب‌هایی را که به آسانی در محیط کشت رشد می‌کنند، شناسایی کند.

اخیراً روش‌های مولکولی متعددی برای تشخیص عفونت‌های جریان خون ابداع شده و به عنوان مکمل روش‌های سنتی برای نتایج سریع‌تر و دقیق‌تر مورد استفاده قرار می‌گیرند. فناوری جدید با استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) در حال حاضر به عنوان یک ابزار تشخیصی برای شناسایی سپسیس و ارگانیسم عامل، سریعتر از کشت خون مورد مطالعه قرار گرفته است.